Ο Αχέροντας, στενά δεμένος με την μυθολογία και μετά από διαδρομή εξήντα τεσσάρων (64) χιλιομέτρων και διασχίζοντάς την πεδίαδα του Φαναρίου, στο βορειοδυτικό τμήμα του νομού και εκβάλλει στο Ιόνιο Πέλαγος, δημιουργώντας πλήθος οικοσυστημάτων και περιοχών ιδιαίτερου φυσικού κάλλους που ευνοούν την ανάπτυξη πολλών φυτών και προσφέρουν ενδιαίτημα σε πολλές κατηγορίες ζωών και πτηνών. Οι πιο αξιόλογες υγροτοπικές περιοχές της περιοχής του Δέλτα είναι το έλος Αμμουδία (βόρεια των εκβολών του ποταμού) και το έλος της Βαλανιδοράχης (νότια των εκβολών) το οποίο όμως είναι μικρότερης έκτασης.